Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDHR2Q9BYE9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDHR2Q9BYE9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDHR2Q9BYE9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDHR2Q9BYE9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDHR2Q9BYE9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDHR2Q9BYE9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDHR2Q9BYE9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDHR2Q9BYE9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDHR2Q9BYE9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDHR2Q9BYE9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDHR2Q9BYE9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDHR2Q9BYE9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDHR2Q9BYE9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms