Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRIP1Q9BX63 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms