Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
VAMP8Q9BV40 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP8Q9BV40 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP8Q9BV40 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP8Q9BV40 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP8Q9BV40 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP8Q9BV40 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP8Q9BV40 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP8Q9BV40 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP8Q9BV40 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP8Q9BV40 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP8Q9BV40 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP8Q9BV40 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP8Q9BV40 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP8Q9BV40 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP8Q9BV40 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP8Q9BV40 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms