Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
COPS4Q9BT78 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms