Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS3Q9BRX5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms