Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms