Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms