Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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SIGMAR1Q99720 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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SIGMAR1Q99720 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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SIGMAR1Q99720 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SIGMAR1Q99720 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SIGMAR1Q99720 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SIGMAR1Q99720 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SIGMAR1Q99720 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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