Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PITX2Q99697 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms