Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NAP1L3Q99457 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms