Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CICQ96RK0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms