Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC7Q96NW7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC7Q96NW7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC7Q96NW7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC7Q96NW7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC7Q96NW7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC7Q96NW7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC7Q96NW7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC7Q96NW7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC7Q96NW7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC7Q96NW7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC7Q96NW7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LRRC7Q96NW7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC7Q96NW7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC7Q96NW7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC7Q96NW7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC7Q96NW7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC7Q96NW7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC7Q96NW7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC7Q96NW7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC7Q96NW7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC7Q96NW7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC7Q96NW7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC7Q96NW7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.51■■■□□ 2
LRRC7Q96NW7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC7Q96NW7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC7Q96NW7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms