Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL15Q96M94 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms