Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC74BQ96LY2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms