Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E2Q96LR5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms