Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPRTQ96BW1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPRTQ96BW1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPRTQ96BW1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPRTQ96BW1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPRTQ96BW1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPRTQ96BW1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms