Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms