Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms