Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUFY2Q8WXA3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms