Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms