Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK2A3Q8NEV1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSNK2A3Q8NEV1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms