Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKAP2LQ8IYA6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms