Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDXQ7Z353 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms