Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms