Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUX4L9Q6RFH8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms