Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms