Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms