Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYW3Q6IPR3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms