Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GGNBP1Q5YKI7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms