Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH8Q5T0T0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH8Q5T0T0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms