Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC158Q5M9N0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms