Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HABP4Q5JVS0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms