Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PCID2Q5JVF3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCID2Q5JVF3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms