Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms