Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0Z9

MCMDC2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMDC2Q4G0Z9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCMDC2Q4G0Z9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCMDC2Q4G0Z9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCMDC2Q4G0Z9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCMDC2Q4G0Z9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms