Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF239Q16600 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF239Q16600 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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