Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
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SGCAQ16586 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
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