Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPE65Q16518 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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