Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSX1Q16384 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms