Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRRQ15256 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms