Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAM2Q15035 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAM2Q15035 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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