Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1D2Q14995 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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NR1D2Q14995 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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NR1D2Q14995 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1D2Q14995 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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