Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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RFTN1Q14699 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN1Q14699 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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