Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEMA3AQ14563 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms