Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VGLL4Q14135 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VGLL4Q14135 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VGLL4Q14135 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VGLL4Q14135 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VGLL4Q14135 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VGLL4Q14135 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VGLL4Q14135 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VGLL4Q14135 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VGLL4Q14135 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VGLL4Q14135 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VGLL4Q14135 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VGLL4Q14135 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VGLL4Q14135 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VGLL4Q14135 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VGLL4Q14135 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VGLL4Q14135 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VGLL4Q14135 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms