Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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