Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDX39BQ13838 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms