Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKP1Q13835 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
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