Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOFQ13790 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOFQ13790 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOFQ13790 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOFQ13790 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOFQ13790 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOFQ13790 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOFQ13790 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOFQ13790 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOFQ13790 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOFQ13790 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOFQ13790 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOFQ13790 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APOFQ13790 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOFQ13790 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOFQ13790 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOFQ13790 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOFQ13790 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOFQ13790 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOFQ13790 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOFQ13790 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOFQ13790 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOFQ13790 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOFQ13790 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOFQ13790 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOFQ13790 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOFQ13790 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOFQ13790 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOFQ13790 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOFQ13790 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOFQ13790 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOFQ13790 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOFQ13790 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOFQ13790 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOFQ13790 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOFQ13790 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOFQ13790 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOFQ13790 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOFQ13790 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOFQ13790 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOFQ13790 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOFQ13790 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOFQ13790 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOFQ13790 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOFQ13790 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOFQ13790 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOFQ13790 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOFQ13790 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOFQ13790 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOFQ13790 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOFQ13790 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOFQ13790 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOFQ13790 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOFQ13790 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOFQ13790 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOFQ13790 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOFQ13790 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOFQ13790 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOFQ13790 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOFQ13790 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOFQ13790 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOFQ13790 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOFQ13790 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOFQ13790 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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