Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPP1R1AQ13522 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPP1R1AQ13522 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPP1R1AQ13522 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms